Un poder extraordinario y desconocido invoca a personajes de diferentes universos, atrayéndolos a un mundo nuevo. Ragna the Bloodedge, Jin Kisaragi, Noel Vermillion, Rachel Alucard, Iron Tager, Nº13, Hazama, Makoto Nanaga, Azrael y Es de BlazBlue, así como Ruby Rose y Weiss Schanee del anime RWBY son transportados materialmente. Yu Narukami, Yosuke Hanamura, Chie Satonaka, Yukiko Amagi de Persona 4 Arena son atraídos a través de los sueños. Hyde, Linne, Waldstein y Gordeau de Undernight In Birth son transportados a través de los portales. Todos serán obligados a luchar en un torneo, en el que el vencedor mantendrá en su poder unos poderosos cristales conocidos como Keystone. Estos cristales les permitirán regresar de vuelta a casa, según les cuenta una misteriosa voz. Bienvenidos a este gran crossover.
Episode Mode
Este modo nos cuenta la historia de los personajes y nos descubre una trama a través de las conversaciones entre personajes. En su lanzamiento el juego nos permite seleccionar entre dos idiomas, el original japonés y el inglés. Meridiem ha prometido incluir los textos al castellano con un parche, que no está de salida para no retrasar el lanzamiento respecto al resto de países.
La historia se presentará en 4 episodios diferentes y un tutorial, cada uno de ellos dedicado a uno de los universos. Estos se basan en la misma historia usando diferentes puntos de vista, lo cual nos permite conocer más a los personajes, incluso lucharemos o dialogaremos con personajes que no están en la plantilla de inicio, como Jubei, Carmine, Aegis, Vatista, y Blake entre otros. El episodio de BlazBlue consta de 9 capítulos, mientras que el resto estará formado por 8 capítulos. Mientras que los episodios de Persona 4 Arena, Undernight in birth y RWBY son historias lineales, en el episodio de BlazBlue podremos elegir entre diferentes opciones en las conversaciones. Según nuestras respuestas podremos ver diferentes finales.
En la historia no podremos seleccionar luchadores, ya que cada universo cuenta con su protagonista. Al tratarse de un juego de lucha Tag Battle (lucha en equipo) el segundo jugador dependerá de los hechos que sucedan en la historia. Así que en cada episodio contaremos con un compañero diferente.